APC (Adenomatous Polyposis Coli – gruczolakowata polipowatość okrężnicy) to gen, który koduje białko APC u ludzi.
Gen
Gen APC znajduje się na chromosomie 5 w regionie q21 i składa się z 21 eksonów. Charakterystyczną cechą tego genu jest obecność dużego eksonu 15, który obejmuje ponad 70% sekwencji kodującej.
Alternatywne transkrypty genu
Produkuje on mRNA o długości 8538 nukleotydów. W pierwszych eksonach genu mogą powstawać specyficzne dla tkanki alternatywne transkrypty. Na przykład w mózgu występuje produkt genu APC, którego kodon startowy znajduje się w eksonie BS (specyficznym dla mózgu). Alternatywne składanie genu może być związane z regulacją aktywności białka APC, co sugeruje, że białko to pełni wiele różnych funkcji w komórkach, biorąc pod uwagę, że dotyczy to ponad 75% eksonów.
Budowa białka
Białko APC o pełnej długości składa się z 2843 aminokwasów i występuje zarówno w cytoplazmie, jak i w jądrze komórkowym. W obrębie białka APC wyodrębniono kilka funkcjonalnych domen. Domena zasadowa obejmuje aminokwasy od 2200 do 2400. N-koniec białka (aminokwasy 1-171) jest zaangażowany w oligomeryzację cząsteczek. Białko APC posiada dwa miejsca wiązania z α-kateniną: w fragmencie zawierającym trzy piętnastonukleotydowe powtórzenia (od 1020 do 1169) oraz w regionie zawierającym dwudziestoaminokwasowe powtórzenia (od 1324 do 2075). Wiązanie z mikrotubulami zachodzi poprzez fragment obejmujący aminokwasy 2130-2483. Aminokwasy 2560-2843 są odpowiedzialne za wiązanie z białkiem EB1, a aminokwasy 2771-2843 wiążą się z białkiem DLG.
Funkcje białka
Ekspresję genu APC stwierdzono we wszystkich tkankach. Białko to wchodzi w interakcje z wieloma innymi białkami, w tym:
- białko DLG
- białko mikrotubul
- GSK-3
- α-katenina
- β-katenina
- p34
- Tid56
- auksyna
Białko APC odgrywa kluczową rolę w regulacji wielu procesów komórkowych, takich jak podział, migracja, adhezja i różnicowanie komórek. Nie zidentyfikowano jednak regionu związanego z procesem apoptozy. W komórkach śluzówki jelita grubego produkt genu APC o masie 300 kDa bierze udział w kontaktowym hamowaniu wzrostu komórek.
Przypisy
Linki zewnętrzne
ADENOMATOUS POLYPOSIS OF THE COLON; APC w bazie Online Mendelian Inheritance in Man (ang.)
GeneCard for protein-coding APC. [dostęp 2007-09-16].